Hvis jorden har tilstrækkelig med stoffer som kvælstof (N), fosfor (P) og kalium (K) men mangler et andet vigtigt næringsstof. f.eks. sporstoffet jern (Fe), så hensygner tomater, kål og bønner. Det nytter ikke at tilføre en masse kunstgødning (NPK) , disse grøntsager bliver aldrig af samme standard, som hvis de var dyrket korrekt.

Dette kan forhindres ved at tilføre kornpost. Komposten består jo af formuldet løv, køkkenaffald, afklippet græs og andet plantemateriale.

Den type gødning benævnes som organisk gødning, i modsætning til handelsgødning, uorganisk gødning eller kunstgødning. Organisk gødning virker på langt sigt. Den skal nemlig først omsættes af jordens mikroorganismer inden den bliver plantetilgængelig. Inden man udspreder komposten bør man undersøge om jorden mangler et specielt næringsstof. Det gøres ved at udtage en jordprøve og indsende til et laboratorium, der foretager sådant.

Gødning fra forskellige dyr kaldes med et ord for "staldgødning". En del af de naturlige gødninger kræver tilsætning af næringsstoffer. Man kan f.eks. tilsætte basaltmel for at opnå balancen med sporstofferne.

I modsætning til staldgødning er stenmel rigt på jern, magnesium og andre stoffer.

Frisk staldgødning er ikke godt at anvende, det skader planterne. Den kraftige animalske gødning brænder plantens rødder, eller også vokser planten alt for hurtigt i vejret og danner kun en masse grønne blade og ingen blomster. Staldgødning skal oplagres eller endnu bedre komposteres. Gennem nedbrydningen dannes giftige stoffer, der efterhånden forsvinder. Frisk gødning skal komposteres i ca. 1 år før den anvendes.

Hvis en plante i urtebedet lider af næringsstofmangel, viser det sig ved at planten ikke vokser ordentligt, den får gule blade og lignende symptomer.

Før man kan gøre noget ved problemet, skal det undersøges først. Ved akut mangel skal man vande med hurtigtvirkende flydende naturgødning. Eksempel på et sådant middel er "nældevand", der er let at fremstille.

Det vigtigste ved den organiske gødning er humusdannelsen. Hvis man gøder med handelsgødning tilføres jorden kvælstof, fosfor, kalium, magnesium og sporstoffer, men den organiske gødning bidrager desuden til at forbedre jordstrukturen. De naturlige stoffer hjælper til med at stimulere mikroorganismerne til fornyet aktivitet.